新系列动画讲述憧憬着“传说中的圣斗士·星矢”的光牙和他的同伴们的故事。描写主人公们为了打倒掳走守护大地和众生和平的女神雅典娜并企图树立新世界的巨大邪恶敌人“Mars”，无论多少次都重新站起来继续战斗的英姿。
在看得见十二宫的圣域某个居城里，女神雅典娜正照看着沉睡中的婴儿光牙。在那时突然产 ... 生了巨大的黑暗并爆炸。崩塌的柱子正要倒向光牙之际，闪耀金色光辉的黄金圣斗士星矢出场!然后，身披斗篷的邪恶之敌Mars也现身了。星矢 VS Mars，最终战果会如何?光牙的命运又会是……!?
从神话时代到现代，每当有邪恶出现之时，正义的希望斗士·圣斗士必然会挺身而出。他们身穿名叫圣衣的武具，为女神雅典娜而战。其中，数次救下雅典娜的青铜圣斗士·天马座星矢等人的友情与战斗的事迹为传说写下新的篇章…… 时间流逝，被封印的战斗之神、火星的守护者玛尔斯的复活逐步逼近。另一方面，星矢所救的少年光牙为雅典娜化身的城户沙织所养育，并为了应对日后的危机而进行着圣斗士的修行……当光牙自身的小宇宙觉醒之时，也就是新的圣斗士传说开始之日！
