某日，一群使用风遁之术的空忍空袭火之国，无数民众和忍者遇害，形势危急。据纲手大人所言，这群不速之客正是在第二次忍者大战中落败的空之团，如今他们怀着复仇之心再次出现。卡卡西（井上和彦 配音）等人则负责侦查空之团的老巢，鸣人（竹内顺子 配音）、小樱（中村千绘 配音）、雏田（水樹奈々 配音）受命组成三人医疗小队，协助名医神农（石塚運昇 配音）前往其徒弟雨琉的家乡医治伤者。另一方面，病入膏肓的大蛇丸得知神农的再生之术业已完成，他命佐助（杉山纪彰 配音）前去寻找神农。这也促成佐助和昔日伙伴宿命的重逢…… 本片为《火影忍者》第五部剧场版动画。
广野紘（下野紘配音）梦想着有朝一日能够成为出色的少女漫画家，因为，身为高中生的他一边完成着学业，一边朝着自己的梦想不断迈进。一次偶然中，广野紘遇见了名为宫村宫子（田口宏子配音）的女孩，这个女孩是广野紘学校里新来的转校生。宫村宫子似乎对广野紘十分有好感，对他纠缠不休，广野紘的青梅竹马新藤景（冈田纯子配音）将这一幕幕看在眼中，心里十分失落。与此同时，热爱篮球运动的新藤景刚刚退出了社团，在体育馆中遇见了热爱电影的少年堤京介（泰勇气配音），堤京介被新藤景矫健的身姿所吸引，开始想要拍摄一部以她为主角的电影。
鸣人这次的任务是保护鬼之国的巫女紫苑。
紫苑拥有两个独一无二的能力。一个是将复活的魔物重新封印；另一个是预言人的死期。紫苑的预言从来没有落空过。然而她对鸣人作出了死之预言——“鸣人，你会死。”
只有一个办法可以逃避紫苑所预言的死亡，那就是远远地离开紫苑。然而鸣人不愿离开她。他必须打退凶恶的魔物，守护紫苑，完成自己的任务。一旦拥有封印能力的紫苑被魔物杀死，世界也会跟着毁灭。
因此，鸣人选择了死亡……
