故事讲述地球遭遇毁灭性瘟疫，一艘星际方舟载着人类逃离，却受到了新的威胁攻击——一种变形的外星力量出现要灭绝人类！

　　一场瘟疫消灭了世界上百分之九十九的人类，其余的都转移到地下。科学家把一个囚犯送回到90年代，来调查该病毒跟一个病毒专家的儿子之间究竟有什么关联。该囚犯的记忆中只留下两条微弱的线索:他挥之不去的童年回忆，以及“十二只猴子”的难解记号。

圣诞前夕，麦卡伦正在华盛顿的机场等待妻子乘飞机归来过节。然而无意中他却发现了一个重大的阴谋 被议会解职的特种部队施上校正率领部下准备解救被引渡的中美洲毒枭艾将军。麦卡伦将此事告知了机场警卫队的罗队长，但后者的官僚作风和愚蠢却使这一切未能得到阻止。施上校带领部下占领了机场附近的一座小教堂，设置了一个飞行控制中心，并切断了机场控制塔与空中的一切联系，使众多的客机无法降落。而麦卡伦的妻子霍莉此时却正在其中的一架飞机上。为了解救妻子和在空中的众多客机，麦卡伦不得不再次进行艰苦的努力。
控制塔试图修复天线的行动失败，恐怖分子更诱使一架飞机坠毁以示警告。麦卡伦虽尽力阻止，但仍无济于事。军方特种部队在关少校的带领下赶到，麦卡伦再次被排斥在行动人员之外。
艾将军控制了押送他的飞机并在机场降落，麦卡伦企图抓住艾将军以控制局面，虽然功败垂成。但也因此而推断出了施上校的巢穴所在。关少校率部突袭教堂。而麦卡伦却在无意间发现，这一切都是一场骗局，关少校等人早已和对方勾结在一起。麦卡伦将消息通知了罗队长，但警卫队却因记者报道引起的混乱而无法行动。
眼看艾将军等人就要乘飞机逃脱，麦卡伦及时搭乘直升机赶到，在飞机的机翼上和对方展开了殊死搏斗。虽然被打落机翼，麦卡伦却乘机拧开了飞机油箱。在飞机即将离地时，麦卡伦点燃了跑道上洒落的汽油。一条火龙沿着油迹追上了刚刚起飞的客机，将艾将军人连人带机炸得粉碎。跑道上绵延数百米的火迹也成了指引飞机降落的指示灯，众多的飞机依次安全降落。在满天飞舞的雪花中，麦卡伦和妻子紧紧地拥抱在一起。

评 析
　　在影片《终极警探》大获成功后，电影公司大获鼓舞，于是又拍摄了影片的续集。布鲁斯·威利斯再接再厉，在《终极警探》Ⅱ中再次大显神威，使影片又一次获得了不俗的反响。
这一集的故事发生地由洛杉矶移到了首都华盛顿；生死搏斗的地点则由大楼改到了机场。但从剧情上来看，影片的第二集很大程度上只是前一集的翻版。布鲁斯·威利斯同样要独自对付一帮训练有素的恐怖分子；警方仍是官僚无能；而军方特种部队则干脆与恐怖分子串通一气。无线通话机依旧是一个重要道具；新闻媒体也仍然在捣乱，前回挨揍的记者今次又在大放厥词，令人讨厌，只不过这次惩罚更重，被狠狠地电了一下。虽然看得出有如此众多的相似点，但影片依旧获得了巨大的成功。原因在于其剧情仍旧颇为吸引人，而场面则更为火爆。赶上圣诞档也是影片大为卖座的一个原因。之所以把场景由洛杉矶移到华盛顿，大概就是后者圣诞时会下大雪，更能增加气氛的缘故吧。而片尾的结束曲也仍是上一集中的那首“Let it snow”，可谓是学得十分到家了。这样翻拍的影片仍旧大获成功，《终极警探》 一片的魅力也由此可见一斑。