福建沿海的一个美丽城市，一家小客栈借着政府鼓励的小三通的东风，生意办得红红火火。小客栈在为两岸的人们提供着便利的同时，也发生了很多感人的故事。客栈的主人蔡金龙是当年金门战役的老兵，努力经营着一家客栈，并有意让自己的儿子蔡解放和儿媳杜丽娜接过这摊子买卖。没想到的是，夫妻俩以离婚不离家而收场。随着台湾某船运公司经理陈世乡的到来，客栈所有的平衡被打破，陈世乡和杜丽娜有情人终成眷属。客栈里其他成员的故事同样精彩。杜丽娜的弟弟永远是英雄过不了美人关，最后发现自己的真爱原来是近在身边的在客栈酒吧里唱歌的方依依；给客栈负责菜食供应的赖木瓜也最终实现了他的大厨梦，并出人意料地迎娶了萧志玲。船来船往，故事不断。
    人进人出，船来船往，来自四面八方的人在老榕树客栈里相遇，他们背景不同、出身不一，却在老榕树里发展出了一段段精采感人的故事。
　　老榕树就像是祖国的缩影，泱泱沛沛、相容并蓄地包容着每一个民族的子民，不管是闽南人、香港人、东北人、四川人，美籍华人，甚至是改革开放后，乘着〝小三通〞的船只过海而来的台湾人，他们相互之间，有矛盾也有沟通；有争执也有妥协；他们彼此扶持走过困难时刻，他们相互分享共度美好时光……
　　因为，他们都是中国人！
　　时装系列单元连续剧《船来船往》是以金厦等地的“小三通”为时代背景，以直航码头边的私家旅馆“老榕树大酒店”以及台湾人创办的“天天来大酒店”为主场景，以两家主人之间的竞争与互动，加上往来形形色色不同身份的房客为主要人物关系，进述了两岸人民同根同源、血肉相亲的动人故事，展开了一幕幕悲喜交织人间戏剧，本剧具有实景拍摄、取材实事的特点。
　　一水之隔，船来船往，客栈里，人群中……，无论寻亲探友、谒祖归宗、经商贸易、寻医问药、文化交流、宗教往来、观光旅游、婚丧嫁娶等林林种种的故事，无不折射出两岸民情、民生、民意的光芒。在不触动两岸政策法规、敏感话题的同时，使观众对本剧认同并具有亲和力。通过一个个生动的情节和鲜活的人物，关照着两岸和平、统一、发展的主题。
　　福建沿海，一处风景秀丽的海滨城市厦门，一直都是两岸往来的重要据点。尤其在小三通后，台海交流日益密切，客人往来不断，然而，位在厦门码头的老榕树客栈却因为经营不善，反而没有分沾到小三通所带来的庞大商机，依旧是门可罗雀。
　　老榕树客栈的老板蔡金龙，是一位战争英雄，退伍之后看上了这片美丽的大海，于是与友人投资这栋多年的老建筑，开启了他经营客栈的道路。然而时空变化，老一代的经营理念已经不符现代的要求，虽然求好心切，却总是力不从心，他的独生子蔡解放，醉心于木偶的世界里，对于客栈的经营一点都不放在心上，每天就是跟社团的人一同切磋、研究甚至是互相攀比自己拥有的珍奇木偶，让蔡金龙振乏力。
　　客栈的服务员阿娇，是一个勤快的惠安姑娘，每天都会把客栈打理的干干净净，一尘不染，但其年轻且天真，常常陷入自己的明星幻想世界，有些不踏实。
　　面对“厦金航线”开通，同业有如雨后春笋般掘起，老榕树大酒店已不敌竞争，生意逐健渐被比邻来自台湾创业的“天天来大酒店”总经理吴俊男等人所抢走。
　　有鉴于此，东家易主为了利益上的考虑，决议由北京请来专业的管理者杜丽娜来提升业绩。
　　精明能干的杜丽娜为老榕树客栈带来了新气象以及新规则。一开始，蔡解放与阿娇都无法适应杜丽娜的独断独行，但为了老榕树的将来与蔡金龙强烈的要求，忍受杜丽娜所带来严格的新制度、新规矩。
　　在杜丽娜的大刀阔斧下，客栈的生意渐渐地有了起色，也刺激了宿敌“天天来大酒店”的斗志振作，在生意上积极竞争，你来我往横生不少趣味。
　　随着人潮来的，就是忙碌。身兼厨师的蔡金龙无法负荷如此大的工作量，做出来的菜色渐渐失去统一标准，让不少慕名而来的客人都颇有怨言。杜丽娜深知这样下去，好不容易建立出来的口碑将会毁于一旦，因此起了请新大厨的念头。一个个性、厨艺都迥异常人名厨－鲍鱼佬，因缘际会地来到了这里，成为了老榕树客栈里关键的一员。
　　故事从杜丽娜应聘为老榕树的总经理以及鲍鱼巧妙加入下，“老榕树大酒店”与“天天来大酒店”，竞争越来越激烈，在这南来北往的要道上，开启了一幕幕温馨感人、幽默逗趣的故事，而两岸三地同根同源的情谊不知不觉之中，已然融合，毕竟……大家都是中国人。