《兄弟》是一部描绘兄弟情的剧情片。故事从一个警探奎（刘德华饰演）的介入而目睹兄弟间之不信任而互斗的故事：尧（苖侨伟饰）及舜（陈奕迅饰）虽然是亲生兄弟，自小感情融洽，但两人年幼时因为父亲的一个决定而分隔两地，多年后家庭突变令他们再次走在一起。父亲（王志文饰）遗言触动尧之感情并布局来达到其目的，令舜身陷险境。

　　苗侨伟和陈奕迅是两兄弟，他们的父亲是社团老大，因为算命先生说兄弟俩日后会相残，所以陈奕迅从小就被送到国外读书，苗侨伟留在家中。黄日华是这位老大的养子，担任苗的保镖。父亲病逝，陈奕迅回到香港，发现已叱咤一时的哥哥苗侨伟不仅不想做社团老大，还想要他接替老大的位置。一直痛恨黑社会的陈奕迅认为哥哥此举是在“害”他，但苗侨伟有自己的苦衷……另一社团首领汤镇业对老大的位置虎视眈眈，在暗中加害苗、陈两人。刘德华则扮演一个调查苗侨伟所在社团的警察，在戏中起着穿针引线的作用。

    王小虎身手不凡且具侠义心肠，在观赏一年一度的抢包山大会时发现有恶霸在现场横行霸道，小虎路见不平，击倒恶霸，最终还误打误撞取得包山顶的花魁，而花魁内藏的竟是一道金牌原来金牌是亚洲犯罪集团罗剎门门主火云邪神所颁的罗刹令，凡抢到罗剎令者便拥有与罗剎门合作的专利权。小虎不知令牌底蕴，在庆功之际被黑帮伏击，因缘际会下他反被同时来取令牌的黑帮保镖王小龙所救，更遇上持双节棍的金发少年石黑龙仗义相助。罗剎令被小龙取得，小虎惊见其身上玉佩，发现小龙竟是其同父异母的兄长。

    小龙身在江湖，却从不沾手犯罪之事，其黑帮大哥马坤交回令牌后，突然宣布退出江湖，火云邪神大怒，遂命养女罗剎女除去马坤。另一方面，小虎欲与小龙相认，求助于马坤爱女马小灵，马小灵在抢包山会场早已对小虎有好感，可惜小龙一时间未能接受小虎。罗剎女围剿马家，马坤被杀，小龙带着马小灵杀出重围，负伤去到龙虎门武馆。小虎及石黑龙得知马家灭门，顿时义愤填膺，龙虎三皇初次聚义，决定替马小灵报仇，遂火烧罗剎门仓库内所有毒品，正式与罗剎门结下不解之怨。火云邪神得知仓库被烧勃然大怒，同时却为得知龙虎门高手如云而感到兴奋莫名。某夜，火云邪神闯入龙虎门，先打死师父王降龙，再以盖世武功将龙虎三皇打得落花流水。火云邪神欲招揽众人加入罗剎门，但龙虎三皇宁死不降，并侥幸逃脱了火云邪神的魔掌。 龙虎门在一夜间被移为平地，马小灵唯有带着伤重的龙虎三皇到中国白云山求医。白云山上内有一名奇侠，其武术与医术皆卓越非凡却性情怪癖，全赖马小灵千方百计用诚意打动奇侠，出手救助龙虎三皇。逃出鬼门关后，龙虎三皇求奇侠传授武术绝学，誓要替师父王降龙报仇。另一方面，火云邪神早已在罗剎门布下天罗地网……