广岛县三次市有一座“稻生神社”，住着稗田仓子、柚子和珠三姐妹。有一天离开家乡已久的高中男生天津忠寻回到了这里，他是“审神者”的后裔，随后神秘的长着天狗面孔的男人乱裁道宗出现了，围绕着神社和学校发生了一系列不可思议的事情，而三姐妹原来是传说中的“巫女”
在“寻”回来的当天，柚子做了小时候的一个梦，在熟睡中被叫醒，仓子预测到寻会有危险，便和珠先出发去接寻。当寻到达时，遇到到了乱裁道宗，在什么都不知道下，仓子和珠赶到，与乱裁道宗战斗。乱裁道宗挟持了寻并唤出魔物，仓子和珠不感妄动。突然柚子骑自行车冲了出来，碰巧撞开了乱裁道宗……
最后三姐妹合力解决了魔物，迎接了寻的归来。
巫女们的战争即将开始了..平成时代的鬼怪，为了召唤出最勇猛的鬼神，立誓要找到继承审神者的少年；眼看负责保护少年的巫女与鬼怪之间的战争即将展开…
人物介绍

天津忠寻
幼年时曾居住于广岛县三次市，母亲为稗田家的后裔。这次回到这裡，发生的一连串的事件应该与他脱不了关係。以一个十五岁的少年的年纪来看，忠寻显得有点过于冷静，而且给人一种冷漠的感觉，但真正的他其实是个很温柔的少年。

　　故事背景于未来世界，人类已由地球移民到其他星系居住；人们为了贪求私欲，便开始研究及制造一种拥有独立思想及感觉的机械人 - Cylons 来为人类服务。但人们怎样也想不到，这些本应是帮助人类的机械人竟会调转头对抗自已，因此，人类与自已制造的机械人之战争便开始展开……

　　在经过数十年漫长、死伤无数的战争结朿后，人们本以为可得到和平的生活，但 Cylons 明白到即使在休战后始终没辨法与人类建立实际的外交关系，故 Cylons 开始密谋另一个对付人类的计划，这次它们将会制造一些与人类一模一样的机械人作间碟渗入人类世界，从而以里应外合的方法把人类消灭。

　　故事猹始于一个外交官去空间站，他没想到这年cylons派了人来，不是他所熟悉的那种机器人，居然是个美女（间谍，复制人，有12个一模一样的）。和平被打破了，cylon悄悄地派出了美女谍进入人类殖民地，并摧毁了人类所有的电脑系统之后发动了攻击。赖以电脑网络生存的人类军队无力反抗，一天之内，cylon几乎消灭了12个殖民地，以及大部分的太空舰队。战舰Galactica由于拒绝接入电脑网络，并且有着优秀的主角们得以生存。人类再次挣扎着……